Da samo završim priču... Ubacio sam par IRLZ44N na način kao što ste opisali, ali je problem ostao isti.
Posle višesatnog njakanja i isprobavanja drugih napajanja, uzeo sam da menjam source code u SoftPWM biblioteci i da podešavam koliko CPU ciklusa koristi tako da treperenje nestane, a 2 kanala koja su bila na klasičnom AnalogOut PWM-u (timer1 ih radi, ako se ne varam, a nisam koristio Serial) sam prebacio na SoftPWM i sad radi odlično, a inače su imali neopisivo dosadnu fadein-fadeout ritmiku.
Ono što je naravno bitno jeste da je IRLZ44N prava stvar za ovo, iako stari IRF540 u suštini hoće da radi, IRLZ44N daje jači izlaz i lepše se da podesiti pošto ga odlično okida 5V PWM sa Arduino izlaza.
Hvala na pomoći!
A man is smart. People are stupid.